Importance épidémiologique, menaces et mesures de biosécurité dans les sites d’escale

La migration des oiseaux est un mouvement régulier saisonnier de grande envergure et de longue distance. Les oiseaux migrent entre leurs « foyers » de reproduction et les terrains non reproducteurs, en quête de nourriture et de lieux de nidification. Les oiseaux migrateurs représentent plus de 80 % de la diversité aviaire mondiale. Ils jouent un rôle essentiel dans le maintien d’un écosystème sain et contribuent à façonner la biodiversité mondiale par la dispersion à longue distance de divers microorganismes et graines.

Les récentes pandémies ont mis en lumière l’interconnexion entre les humains et les animaux exotiques au sein d’un même écosystème. L’un des principaux éléments clés pour prédire l’émergence de maladies infectieuses est une compréhension approfondie de la dynamique de transmission qui relie les animaux sauvages, domestiques et les humains. Chaque année, plus de 2 000 espèces migrent à travers le monde avec de grandes variations dans le temps et la direction de la migration parmi et au sein des espèces, ainsi que la distance parcourue. Un intérêt croissant est porté aux oiseaux migrateurs car lors de leur voyage migratoire, ils peuvent rencontrer un large éventail de pathogènes et de vecteurs, qui pourraient être facilement transmis aux communautés résidentes en cours de route. Ces oiseaux, dits « migrateurs », ont une capacité unique à voler sur de longues distances entre les continents en peu de temps, franchissant des barrières géographiques majestueuses avec peu de considération pour les frontières nationales ou continentales. Par exemple, de nombreuses frontières internationales ont été fermées en raison du COVID-19, tandis que de nombreuses espèces d’oiseaux sauvages ont continué à traverser les frontières des pays et des continents lors de leurs migrations.

Pendant leurs vols, les oiseaux migrateurs peuvent jouer un rôle de réservoirs “véhicules” et de navette de transport pour la propagation géographique et la dissémination de nombreux agents pathogènes infectieux et de leurs hôtes arthropodes “vecteurs”. Le voyage migratoire est principalement divisé en plusieurs étapes de migration, entrecoupées de périodes d’escale pour se nourrir et se préparer à la prochaine étape de migration. Ces sites d’escale représentent une bonne opportunité pour l’attachement de nouveaux vecteurs et le détachement de vecteurs déjà nourris sur les oiseaux, ainsi que l’acquisition, la dissémination et la propagation des agents pathogènes.

Parmi les agents pathogènes les plus couramment transmis, on trouve le virus du Nil occidental, l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP), le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo, le virus de la maladie de Newcastle, le virus de l’encéphalite à tiques, le virus de l’encéphalite japonaise et le virus de l’encéphalite de Saint-Louis. En plus de certaines bactéries zoonotiques telles que Salmonella enterica, Campylobacter jejuni, Mycobacterium avium et Chlamydia pscittci. De plus, les oiseaux migrateurs sont d’importants réservoirs de propagation de bactéries résistantes aux antimicrobiens (RAM).

Certains de ces agents pathogènes ont été transférés en tant qu’infections nouvelles vers de nouvelles zones le long des voies de migration des oiseaux sauvages à travers l’Europe, l’Asie et l’Afrique. Par exemple, le virus de l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) a très probablement été introduit dans l’UE par le biais d’oiseaux sauvages migrateurs, un facteur clé de l’émergence de l’IAHP, par le contact entre la volaille et les oiseaux sauvages. De plus, des fluctuations saisonnières de la prévalence globale de l’IAV dans les populations d’oiseaux sauvages aquatiques ont été observées et associées aux taux de renouvellement des populations et à la migration.

L’un des facteurs les plus importants affectant les oiseaux migrateurs est le changement climatique. Ces oiseaux sont très sensibles au changement climatique, qui affecte considérablement les habitats naturels, les conditions de vie et la population végétale et la biodiversité. Le climat peut affecter la distribution des passereaux hivernants de deux manières principales. Premièrement, la disponibilité de la nourriture, principalement d’origine végétale, est affectée par les précipitations, la température ou l’humidité, ce qui influence l’abondance des oiseaux. Deuxièmement, les basses températures augmentent les besoins énergétiques des oiseaux, ce qui entraîne une augmentation de la prise de nourriture. En revanche, un temps chaud permet à plus d’oiseaux de se produire à un niveau de productivité donné.

En ce qui concerne le statut des oiseaux migrateurs en Europe, il existe quatre principales routes géographiques pour l’entrée des oiseaux sauvages en Europe : la route nord-est (via la frontière avec la Russie et la Biélorussie), la route est (via la frontière avec l’Ukraine, la Moldavie, la mer Noire, la Turquie jusqu’à la frontière sud de la Turquie), la route sud (via la frontière du sud de la Turquie au nord du Portugal) et la route nord-ouest (via la frontière du nord du Portugal au nord de la Russie).

La route sud est limitée par la région méditerranéenne, et l’entrée par cette voie se produit principalement au printemps lorsque les oiseaux migrent depuis leurs zones d’hivernage africaines. La mer Méditerranée est une mer semi-fermée, ce qui rend la région méditerranéenne très sensible aux changements climatiques. La région méditerranéenne est considérée comme l’une des plus vulnérables aux impacts désastreux du changement climatique dans le monde. Cette région souffre déjà de fluctuations extrêmes des températures et des précipitations, ainsi que de la rareté de l’eau naturelle et des terres agricoles. Ces tendances sont prévues pour s’aggraver dans les années à venir, et par conséquent, le changement climatique influencera l’étendue et la pertinence de ces zones d’hivernage pour les oiseaux. Il a été prédit que de nombreuses espèces transsahariennes réduiront et déplaceront leur aire d’hivernage en raison de l’effet du changement climatique. Ces changements ont des implications potentielles pour la conservation car ils peuvent affecter la survie ou le succès reproducteur ultérieur des oiseaux migrateurs et donc les tendances de leurs populations.

Le long du bassin méditerranéen, il existe divers lieux de repos fondamentaux pour les millions d’oiseaux migrateurs lors de leur vol de migration entre l’Eurasie et l’Afrique. Ces zones représentent des lieux favorables tant pour l’étude des espèces d’oiseaux que pour la surveillance de certaines maladies transfrontalières et zoonotiques transmises par des vecteurs.

En plus de l’impact du changement climatique, les oiseaux migrateurs sont confrontés à une série de menaces. Par exemple, les habitats de reproduction et d’hivernage des oiseaux migrateurs exotiques ou sauvages deviennent de plus en plus sujets à l’envahissement en raison du développement humain. Il existe également une approche directe pour décimer le nombre de ces oiseaux afin de prévenir/mitiger la propagation des maladies infectieuses, ce qui est en contradiction avec l’objectif durable des Nations unies de réduire significativement la perte de biodiversité tout en maintenant une bonne santé et un bien-être. D’autres menaces sont représentées par l’intensification agricole sur les sites de reproduction, le développement des infrastructures énergétiques le long des routes migratoires et la prise illégale aux sites d’escale.

La surveillance du principal réservoir naturel des espèces de virus de la grippe aviaire chez les oiseaux migrateurs, basée sur la carte des voies de migration, est bien documentée comme l’une des premières façons de détecter la propagation de la grippe aviaire. La surveillance annuelle de ces oiseaux est nécessaire et doit être poursuivie de manière plus sérieuse pour protéger l’environnement et l’industrie avicole dans la région, voire dans tout le pays. Les sites d’escale sont des voies pour les oiseaux pour propager des maladies entre les populations et les espèces lorsqu’ils sont surpeuplés ainsi que dans les plans d’eau. Malheureusement, la capacité à prévoir les sites d’escale ainsi qu’à comprendre leurs caractéristiques spatiotemporelles fait encore défaut et doit être améliorée.

Enfin, la mise en œuvre de mesures de biosécurité spécifiques est précieuse pour réduire la probabilité d’émergence de maladies transfrontalières et de leurs vecteurs par les oiseaux migrateurs. Parmi ces mesures figurent : 1) Alerte précoce aux habitants du chemin migratoire de ces oiseaux pour qu’ils utilisent des équipements de protection individuelle ; 2) Vaccination spéciale des volailles locales et des animaux à l’avance sur les sites d’escale ; 3) Désinfection des sites d’escale et des trajets migratoires par fumigation ; 4) Confinement temporaire des habitants autour des sites d’escale pour minimiser les interactions et les contacts avec les oiseaux sauvages.

En conclusion, une grande attention et un intérêt sont dirigés vers les oiseaux migrateurs car ils rencontrent un large éventail de pathogènes et de vecteurs, certains d’entre eux étant des agents pathogènes mortels. Pendant leurs vols, ces oiseaux migrateurs peuvent jouer un rôle de réservoirs ou de navette de transport pour la propagation géographique et la dissémination de ces agents pathogènes et de leurs hôtes arthropodes “vecteurs” aux communautés résidentes. Les oiseaux migrateurs sont confrontés à une série de menaces telles que les changements climatiques, le développement humain, l’intensification agricole et le développement des infrastructures énergétiques le long des routes migratoires. Ces menaces ont des implications potentielles pour la conservation des oiseaux migrateurs et les tendances de leurs populations.

La région méditerranéenne, route sud des oiseaux migrateurs vers l’Europe au printemps, comporte divers lieux de repos fondamentaux pour les millions d’oiseaux migrateurs lors de leur vol de migration entre l’Eurasie et l’Afrique. En raison des changements climatiques extrêmes dans cette région, de nombreuses espèces d’oiseaux migrateurs transsahariens sont prévues pour réduire et déplacer leur aire d’hivernage.

Les sites d’escale sont des voies pour les oiseaux pour propager des maladies entre les populations et les espèces. La collecte continue de données météorologiques et environnementales pertinentes est une pierre angulaire essentielle alors que ces oiseaux se déplacent en réponse à des changements dans ces variables. La surveillance annuelle de ces oiseaux est nécessaire pour protéger l’environnement et les habitants humains et animaux. La mise en œuvre de mesures de biosécurité spécifiques est précieuse pour réduire la probabilité d’émergence de maladies transfrontalières et de leurs vecteurs par les oiseaux migrateurs.

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